估计阅读时长: 17 分钟https://github.com/rsharp-lang/R-sharp/tree/master/studio/RData 在最近的工作中,需要将Docker容器内的R环境之中的数据集无缝的串流到下游的.NET Core数据分析环境之中,基于.NET Core代码库进行数据可视化之类的操作。目前在R环境与.NET Core环境之间进行交互仅存在有一个比较出名的R.NET项目。但是对于使用R.NET项目而言,我们只能够在.NET Core环境之中调用R环境做数据分析,并不能够实现R环境调用.NET Core数据分析环境。并且R.NET项目必须要依赖于R环境对应的库文件,所以使用R.NET并不能够满足我们在Docker容器间进行R数据分析环境与.Net Core数据分析环境之间的无缝衔接。 Order by Date Name Attachments RStudio_Logo • 185 […]

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其实,你不应该直接跑原始表达矩阵的。因为在原始表达矩阵中,基因的特征数量可能会非常多,做随机森林或者SVM建模就会会非常久。应该先用limma程序包对矩阵筛选一次,例如用log2fc绝对值按照阈值cutoff筛选一次,或者对log2fc绝对值排序后取前1000个特征,得到小一些feature集合的矩阵后再使用这个程序包做机器学习分析。
Thanks for taking the time to create this.
就是随便看看!
c⌒っ゚Д゚)っ救命啊,谢老师,我试了下用这个程序包直接跑转录组矩阵,跑了好久都没有结果