估计阅读时长: 10 分钟  https://github.com/xieguigang/LLMs 大语言模型从2023年开始,在最近几年非常的火爆。在最近的一段时间,有大语言模型自动化处理数据的需求,开发了一个基于Ollama服务的客户端来通过大语言模型执行自动化任务。在这里记录下这个开发过程。 Ollama介绍 Ollama 是一个开源的大型语言模型(LLM)服务工具,专注于简化本地环境中大模型的部署与管理。它通过类似 Docker 的框架设计,让用户能以极低门槛在个人电脑或服务器上运行各类开源模型(如 Llama 3、Mistral、DeepSeek 等),实现数据隐私与离线推理的平衡。 Order by Date Name Attachments […]
估计阅读时长: 9 分钟https://github.com/rsharp-lang/bing-academic 必应学术是由微软必应团队联合微软研究院打造的免费学术搜索产品。旨在为广大研究人员提供海量的学术资源,并提供智能的语义搜索服务。目前已涵盖多学科学术论文、国际会议、权威期刊、知名学者等方面。搜索位置:http://cn.bing.com/academic。 Order by Date Name Attachments Bing_Logo • 14 kB • 641 click 2021年8月14日html-compression • […]
估计阅读时长: 5 分钟https://github.com/rsharp-lang/Rserver 在R语言之中,存在有一个FastRWeb的框架可以将R语言编写的脚本以http服务的方式运行于后台,供其他的语言进行调用。在R#语言之中,我也模仿着R语言之中的FastRWeb框架,创建了一个用于R#语言的web服务的程序包框架。 Order by Date Name Attachments httpr_commandline • 28 kB • 682 click 2021年6月16日http_PUT_test • […]
估计阅读时长: 12 分钟https://github.com/biocad-cloud/web HTTP协议(Hypertext Transfer Protocol)是建立在TCP协议基础上的一种文件传输协议。 Order by Date Name Attachments https-secure-webpages_waifu2x_art_noise3_scale_tta_1 • 770 kB • 689 click […]
博客文章
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  1. […] 我们在基于前面所论述的《通过diamond软件进行blastp搜索》对大规模的基因组数据进行了代谢酶的EC number的注释以及按照文章《基因组功能注释(EC Number)的向量化嵌入》的方法,得到了一个比较大的基因组代谢酶TF-IDF嵌入丰度矩阵后,如果将这里所得到的嵌入结果矩阵中的基因组,基于Family层级的物种分类分组看作为单细胞转录数据中的细胞分群结果,能否基于单细胞数据分析方法来分析和可视化我的基因组功能嵌入的结果矩阵呢? […]

  2. […] 我们在基于前面所论述的《通过diamond软件进行blastp搜索》对大规模的基因组数据进行了代谢酶的EC number的注释以及按照文章《基因组功能注释(EC Number)的向量化嵌入》的方法,得到了一个比较大的基因组代谢酶TF-IDF嵌入丰度矩阵后,如果将这里所得到的嵌入结果矩阵中的基因组,基于Family层级的物种分类分组看作为单细胞转录数据中的细胞分群结果,能否基于单细胞数据分析方法来分析和可视化我的基因组功能嵌入的结果矩阵呢? […]

  3. […] 在前面的一篇《基因组功能注释(EC Number)的向量化嵌入》博客文章中,针对所注释得到的微生物基因组代谢信息,进行基于TF-IDF的向量化嵌入之后。为了可视化向量化嵌入的效果,通过UMAP进行降维,然后基于降维的结果进行散点图可视化。通过散点图可视化可以发现向量化的嵌入结果可以比较好的将不同物种分类来源的微生物基因组区分开来。 […]