估计阅读时长: < 1 分钟HE染色（苏木精-伊红染色，Hematoxylin and Eosin Staining）是一种组织学和病理学中广泛应用的技术，用于染色组织切片以便于显微观察。该技术利用两种染料——苏木精和伊红，分别染色细胞核和细胞质，从而呈现出清晰的细胞结构。用于观察组织和细胞的形态结构。HE染色技术因其简单、高效的特点，成为组织学、胚胎学和病理学研究中不可或缺的基础方法。HE染色通过苏木精和伊红的染色作用，帮助观察和区分细胞核与细胞质及细胞外基质的形态结构。解读HE染色结果需要结合实验背景和研究目的，观察染色的均匀性、对比度以及细胞和组织的形态变化，从而提供重要的实验依据。 HE染色技术的历史可以追溯到19世纪末： 1868年：德国病理学家Karl Weigert开发了苏木精染色法，用于染色细胞核。 1877年：Albrecht von Leube开发了伊红染色法，用于染色细胞质。 1876年：化学家Wissowzky首次联合使用苏木精和伊红，但未被认为是发明者。 1886年：Paul Ehrlich发表了相关研究，推动了HE染色技术的标准化和广泛应用。
[…] 我们在基于前面所论述的《通过diamond软件进行blastp搜索》对大规模的基因组数据进行了代谢酶的EC number的注释以及按照文章《基因组功能注释（EC Number）的向量化嵌入》的方法，得到了一个比较大的基因组代谢酶TF-IDF嵌入丰度矩阵后，如果将这里所得到的嵌入结果矩阵中的基因组，基于Family层级的物种分类分组看作为单细胞转录数据中的细胞分群结果，能否基于单细胞数据分析方法来分析和可视化我的基因组功能嵌入的结果矩阵呢？ […]
[…] 我们在基于前面所论述的《通过diamond软件进行blastp搜索》对大规模的基因组数据进行了代谢酶的EC number的注释以及按照文章《基因组功能注释（EC Number）的向量化嵌入》的方法，得到了一个比较大的基因组代谢酶TF-IDF嵌入丰度矩阵后，如果将这里所得到的嵌入结果矩阵中的基因组，基于Family层级的物种分类分组看作为单细胞转录数据中的细胞分群结果，能否基于单细胞数据分析方法来分析和可视化我的基因组功能嵌入的结果矩阵呢？ […]
[…] 对于基于ec number来生成层级数据，我们直接使用《酶EC编号结构解析》文章末尾所展示的层级数据生成函数来实现。 […]
[…] 在前面的一篇《基因组功能注释（EC Number）的向量化嵌入》博客文章中，针对所注释得到的微生物基因组代谢信息，进行基于TF-IDF的向量化嵌入之后。为了可视化向量化嵌入的效果，通过UMAP进行降维，然后基于降维的结果进行散点图可视化。通过散点图可视化可以发现向量化的嵌入结果可以比较好的将不同物种分类来源的微生物基因组区分开来。 […]
😲啊？